Gereja Masehi Advent Hari Ketujuh di Bogor pertama kali berdiri pada tahun 1946 di sebuah rumah di Jl. Batutulis, di bawah penggembalaan Pdt. Rintonga. Seiring waktu, pertumbuhan jemaat terus terjadi sehingga tempat tersebut tidak lagi memadai. Akhirnya dicari lokasi baru dan dibeli sebuah rumah milik warga Arab di kawasan Pasar Gembrong. Menariknya, rumah ini sebelumnya sempat ditawar oleh Pemerintah Kota Bogor, namun ditolak oleh pemilik rumah dan baru diberikan kepada jemaat Advent. Pemerintah kemudian menawarkan tukar lokasi rumah itu dengan sebidang tanah seluas 2.500 m² di Jl. Pajajaran, yang hingga kini menjadi lokasi tetap GMAHK Bogor. Setelah proses tukar-menukar selesai, dibangunlah tempat untuk Sekolah Sabat anak-anak yang kemudian digunakan juga untuk kebaktian sejak 1966. Pembangunan dilanjutkan tahun 1967 dengan peletakan fondasi bangunan utama. Sebelum tahun 1980, kantor Konferens Jawa Barat sempat berlokasi di kompleks ini, lalu kemudian dipindah ke Jakarta dan bangunan kantor diubah menjadi ruang-ruang kelas sekolah dasar. Tahun 2002, fondasi lama itu dibongkar dan diganti fondasi sebagai bagian dari proses pembangunan gereja yang baru. Bangunan GMAHK Bogor diresmikan dan ditahbiskan pada tahun 2018. Saat ini, kompleks GMAHK Bogor terdiri dari bangunan gerja dan bangunan sekolah untuk tingkat TK, SD, SMP, hingga SMA.